外科教父

《外科教父》

1304章 你特么挺能猜的

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“是,教授。”陆小路认真点头。

格里芬非常兴奋,他的意见得到杨教授的认可,这可是他进修史上可以吹牛的高光事件。

安排完结构解析的工作,杨平转向另一个难题:“即使有了结构,设计K因子也是个挑战。传统的抗体或小分子都难以满足要求,抗体太大,难以穿透肿瘤基质;小分子特异性不够,容易脱靶。”

教授都说难,那真的难。

“结构解析可以交给我。”陆小路主动请缨,“我们研究所不是刚刚安装了冷冻电镜嘛,300kV的Titan Krios,配套了最新的直接电子探测器,如果样本准备得好,理论上可以解析到近原子分辨率。”

“需要多少样本?”宋子墨问。

“这方法有先例吗?”宋子墨问。

“2019年《自然》上有篇论文,解析了细胞突触中NMDA受体的原位结构,分辨率到了4.5埃。”杨平准确引述,“关键在于标记技术和图像处理算法。金标记可能会干扰蛋白天然构象,我们现在有更好的选择——基因编码的迷你标签,比如ALFA-tag或SpyTag,可以共价结合特异的纳米标记物,干扰更小。”

格里芬没想到杨教授居然对这种偏门论文都有过涉猎,他的知识面这么广。

“纯化后的蛋白复合物,至少需要0.5毫克,纯度要在95%以上。”陆小路报出数字。

唐顺倒吸一口凉气:“从胰腺癌细胞里纯化出0.5毫克膜蛋白复合物?这得培养多少细胞?”

“至少……500升培养规模。”徐志良迅速心算,“而且……膜蛋白纯化得率通常低于1%,实际……需要更多。”

“按常规速度这起码要两个月才行,不过使用我们的扩增技术可以加快培养速度,你们将样本细胞取来交给我,我来培养,培养细胞是我们的老本行。”唐顺接来培养细胞的工作。

“也许有另一种思路可以节约时间,让观察立即开始。”一直沉默的格里芬突然开口,他的中文很流利。

陆小路的眼睛亮了起来:“如果能在癌细胞原位看到这个身份锁的结构,不仅能指导K因子设计,还能验证它在真实肿瘤微环境中的状态,这比纯化后可能失活变性的蛋白更有意义。”

“但技术难度很大。”格里芬谨慎地说,“冷冻电子断层扫描对样本制备要求极高,图像信噪比低,数据处理复杂……”

“我们可以试试。”杨平拍板,“陆小路,这个方向由你负责,多与格里芬交流,先从少量细胞开始摸索条件。”

“也许可以借鉴自然界的灵感。”宋子墨若有所思,“教授,还记得您之前提到过的分子胶水概念吗?某些天然化合物能够将两个原本不结合的蛋白拉在一起。如果我们能找到或设计一种分子,能特异性地将

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张林兴冲冲地离开实验室后,杨平将注意力转回大屏幕上的“身份图谱”。

即使这真是胰腺癌的共性靶点,设计出能精确识别它的K因子也非常难,更别说还要保证新的K因子的安全性、特异性、递送效率……”

杨平分析道:“现在我们面临几个技术难关——蛋白复合物的三维结构解析;基于该结构设计具有高亲和力与特异性的K因子; K因子在体内的稳定性与递送系统。设计K因子是最难的,虽然我们有现在的K因子做参考这也是一件难度极大的工作。”

所有人都看向他。

格里芬走到白板前,拿起笔:“我在美国时参与过一项非传统结构解析的工作。当时我们面对的是一个极难纯化的膜受体,最后采用了原位结构解析的方法,不是纯化蛋白,而是在接近天然状态的细胞膜上直接观察。”

他画了个简单的示意图:“具体来说,我们将目标蛋白标记上金纳米颗粒,通过低温电子断层扫描技术,对完整细胞的局部区域进行三维成像。虽然分辨率达不到原子级别,但足以看清蛋白的大致构象和关键相互作用界面。有了这些信息,就可以用计算模拟的方法补全原子细节。”

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